Formålet med misjonsforsamlingens virksomhet ut fra Ebeneser Bedehus er Jesu ord i Misjonsbefalingen (Matt. 28,18-20). Gjennom virksomheten vil en samle mennesker i alle aldre til vekkende og oppbyggende møter. Målet er at mennesker skal bli frelst, og at den enkelte kristne skal styrkes og bevares i troen på Jesus Kristus. Virksomheten skal også fremme et aktivt indre- og ytremisjonsarbeid ved å forkynne misjonskallet og informere om misjonsarbeidet.