Skjærgårdskirken er en evangelisk menighet, med Bibelen som eneste rettesnor for tro, lære og liv. Menigheten skal gjennom sine aktiviteter, forkynne evangeliet om Jesus Kristus. Skjærgårdskirka vil utvikle aktiviteter tilpasset alle aldersgrupper, og den vil bygge sin virksomhet på mottoet «Elske Gud og elske hverandre»